Remy Froissart, CNRS

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====== CORONAVIRUS ======

====== Sites d'informations générales ======
===== en français =====
  * [[https://www.lemonde.fr/blog/realitesbiomedicales/2020/12/21/royaume-uni-un-variant-du-coronavirus-sars-cov-2-porteur-de-nombreuses-mutations/|Royaume-Uni : un variant du coronavirus SARS-CoV-2 porteur de nombreuses mutations]] -- article du Monde par M. Gozlan, 21/12/20
  * [[https://www.who.int/fr/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019/advice-for-public/q-a-coronaviruses|les réponses aux questions de la part de l'Organisation Mondiale de la Santé (OMS)]]
  * [[https://www.lequotidiendumedecin.fr/specialites/infectiologie/la-covid-19-est-un-reel-danger-deux-scientifiques-font-le-point-sur-le-coronavirus-sars-cov-2|un excellent article du "Quotidien du médecin" : « La Covid-19 est un réel danger ! »]] voir le [[texte]] et le {{:200306_quotidien_du_medecin.pdf|pdf}}
  * [[https://legrandcontinent.eu/fr/2020/03/07/bilan-coronavirus/|un bilan en 10 points sur le Coronavirus]]
  * [[https://legrandcontinent.eu/fr/2020/03/10/coronavirus-un-temoignage-du-front/|Témoignage (terrifiant) du front d'Italie]]
  * Site d'information de la fac de Lyon : "[[https://ecofect.universite-lyon.fr/communique-sur-le-coronavirus-16-mars-2020-156468.kjsp?RH=3147755417607502|Le virus ne circule pas en France, ce sont les hommes et les femmes qui le font circuler]]"
  * [[https://dc-covid.site.ined.fr/|Données de l'institut National des études démographiques]] avec les données européennes de décès par sexe et par âge. 
{{ :article_le_parisien_pic_epidemique.png?300 |[[https://ecofect.universite-lyon.fr/medias/photo/article_1584348839149-png?ID_FICHE=49490]]}} 

  * Article du Figaro  : "[[https://www.lefigaro.fr/sciences/pour-stopper-le-coronavirus-il-faut-diviser-par-quatre-nos-interactions-sociales-20200312|Pour stopper le coronavirus, il faut diviser par quatre nos interactions sociales]]" (Samuel Alizon explique les mécanismes de transmission et l'épidémiologie du virus)
  * en lien avec l'article de Samuel dans Le Figaro, à propos des prédictions qu'on peut faire suite aux mesures de distanciation sociale : "[[https://sciencetonnante.wordpress.com/2020/03/12/epidemie-nuage-radioactif-et-distanciation-sociale/?fbclid=IwAR38fFU2gz6Pgv8FNif0ADVBC06i9J-DSR8rd9rxgGXjhHUF5xYRrVVjrnU|Une épidémie est une réaction en chaîne]] (...)" de D. Louapre
  * Vidéo concernant les informations médicales : "[[https://video.lemediatv.fr/videos/watch/46df425d-0f1f-46aa-b5a7-218c5275c5e4|L'échange inquiétant de médecins en première ligne]]" -- présentation de 10 min' du Dr Timsit puis discussion entre médecins (Le Média -- 10 mars)
  * [[https://www.lemonde.fr/les-decodeurs/article/2020/02/27/en-carte-visualisez-la-propagation-mondiale-de-l-epidemie-de-coronavirus_6031092_4355770.html|Suivi de la propagation de la pandémie en France et dans le monde sur le site du Monde]]
  * La Vie des idées : Savoir et prévoir / [[https://laviedesidees.fr/Savoir-et-prevoir.html?fbclid=IwAR1TuAFCLJIDtC-NGvu8rbPk5szPCubzHk8E_X4y1h0ayy4Hq0sc6_QIXqE|Première chronologie de l’émergence du Covid-19]]
  * [[https://theconversation.com/la-france-en-penurie-de-masques-aux-origines-des-decisions-detat-134371|pénurie de masques : aux origines des décisions d’État]] The Conversation -- 22 mars


  * « [[https://lejournal.cnrs.fr/articles/la-science-fondamentale-est-notre-meilleure-assurance-contre-les-epidemies|La science fondamentale est notre meilleure assurance contre les épidémies]] » -- interview de B. Canard, CNRS
  * Toujours de B. Canard : "[[https://universiteouverte.org/2020/03/04/coronavirus-la-science-ne-marche-pas-dans-lurgence/|Coronavirus : la science ne marche pas dans l’urgence !]]" et son [[https://www.lemonde.fr/sciences/article/2020/02/29/bruno-canard-face-aux-coronavirus-enormement-de-temps-a-ete-perdu-pour-trouver-des-medicaments_6031368_1650684.html|interview]] au Monde (29 Fev. 2020)

=== DIVERS ===
  * [[https://solidarites-sante.gouv.fr/actualites/presse/dossiers-de-presse/article/covid-19-_conseil-scientifique-covid-19|Communiqués et dossiers de presse du Conseil scientifique COVID-19]] auprès du ministre de la Santé français et de la présidence de la République
  * à propos de l'emballement médiatique sur l'[[sciences:divers:raoult|Hydroxychloroquine et Didier Raoult]]



===== en anglais =====

  * Very well done website : [[https://ourworldindata.org/coronavirus|Coronavirus Disease (COVID-19)]] (by M Roser, H Ritchie & E Ortiz-Ospina)
{{ :flattening-the-curve-3-786x550.png?250 |https://ourworldindata.org/uploads/2020/03/Flattening-the-curve-3-786x550.png}} 
  * [[https://www.washingtonpost.com/graphics/2020/world/corona-simulator/|"Why outbreaks like coronavirus spread exponentially and how to 'flatten the curve' "]] (by H. Stevens du Washington Post - 14 march 2020 -- animations très pédagogiques !)
  * [[https://twitter.com/MarkJHandley/status/1237119688578138112|Concerning the COVID19 epidemy]] in different countries (Mark Handley on Twitter)
  * "[[https://www.the-scientist.com/news-opinion/how-covid-19-is-spread-67143|How COVID-19 Is Spread]]" -- The Scientist -- and [[https://www.the-scientist.com/news-opinion/coronavirus-landing-page-67127|latest news]] 
  * [[https://www.newyorker.com/science/elements/from-bats-to-human-lungs-the-evolution-of-a-coronavirus|un article du New-Yorker]]



===== autres =====
  * en allemand : [[https://www.zeit.de/wissen/gesundheit/2020-03/roberto-burioni-italien-virologe-coronavirus/komplettansicht|interview]] de Roberto Burioni, virologue, Italie 


====== Du côté scientifique ======

===== Articles =====

  * Excellent article de synthèse : [[https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)30567-5/fulltext|How will country-based mitigation measures influence the course of the COVID-19 epidemic?]] -- 9 March 2020 -- Lancet
  * [[https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2762130|Characteristics of and Important Lessons From the Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) Outbreak in China]] by Wu & McGoogan -- 24 Feb 2020 -- Science
  * [[https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.01.30.20019844v4|The impact of transmission control measures during the first 50 days of the COVID-19 epidemic in China]] -- MedRxiv
  * [[http://virological.org/t/phylodynamic-analyses-of-outbreaks-in-china-italy-washington-state-usa-and-the-diamond-princess/439|Phylodynamic Analyses of outbreaks in China, Italy, Washington State (USA), and the Diamond Princess]] (by Tanja Stadler'group from ETH Zürich, Basel, Switzerland & Swiss Institute of Bioinformatics)
  * [[https://www.imperial.ac.uk/mrc-global-infectious-disease-analysis/news--wuhan-coronavirus/|Impact of non-pharmaceutical interventions (NPIs) to reduce COVID-19 mortality and healthcare demand]] -- 16 March 2020 - Imperial College London‌
  * [[https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/22221751.2020.1733440|No credible evidence supporting claims of the laboratory engineering of SARS-CoV-2]]

à propos des cas asymptomatiques : 
  * [[https://cmmid.github.io/topics/covid19/control-measures/pre-symptomatic-transmission.html|Contribution of Pre-symptomatic Transmission to the COVID-19 Outbreak]]
  * [[https://science.sciencemag.org/content/early/2020/03/13/science.abb3221?utm_campaign=SciMag&utm_source=JHubbard&utm_medium=Facebook|Substantial undocumented infection facilitates the rapid dissemination of novel coronavirus (SARS-CoV2)]] -- March 16th -- Science
  * [[https://www.nature.com/articles/d41586-020-00760-8?utm_source=Nature+Briefing&utm_campaign=acbbb03b4a-briefing-dy-20200316&utm_medium=email&utm_term=0_c9dfd39373-acbbb03b4a-44751913|How much is coronavirus spreading under the radar?]] -- 13 mars -- Nature
  * [[https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)30627-9/fulltext|COVID-19 and Italy: what next?]] -- 13 mars -- Lancet


  * [[https://github.com/COVID-universities/open-letter/raw/master/open_letter_universities.pdf|open letter to university leaders]]

**à propos des traitements** : 
  * [[ https://c19early.com/|Analysis of the efficacy of early treatments for COVID-19]]

Pages from publishing companies
  * [[https://www.cell.com/2019-nCOV|Cell Press Coronavirus Resource Hub]]
  * [[https://www.elsevier.com/connect/coronavirus-information-center|Elsevier’s free health and medical research on novel coronavirus (COVID-19)]]
  * [[https://www.thelancet.com/coronavirus/archive|The Lancet has created a Coronavirus Resource Centre]]

  * en français : [[http://covid-ete.ouvaton.org/index.html|Estimation du taux de reproduction de l’épidémie de COVID-19 en France]]
  * discussion sur le lien entre [[science:biodiversité et crise sanitaire]]


===== Sites de suivis moléculaires et épidémio =====
  * Site extrêmement complet : [[https://ourworldindata.org/coronavirus|Our World in Data]] (data from WHO)
  * [[http://virological.org/c/novel-2019-coronavirus/ncov-2019-genomic-epidemiology|Un site de dépôts d'analyses]] concernant l'épidémiologie génomique du nCoV-2019 
  * [[https://nextstrain.org/ncov|Nextstrain / ncov]]
  * [[https://shiny.john-coene.com/coronavirus/|John Coene Institut]]
  * [[https://www.worldometers.info/coronavirus/|Worldometer]]

  * [[https://cmmid.github.io/topics/covid19/current-patterns-transmission/global-time-varying-transmission.html|Temporal variation in transmission during the COVID-19 outbreak | CMMID Repository]]

Modélisation en ligne
  * [[https://gabgoh.github.io/COVID/index.html|Epidemic Calculator]]
  * Simulation des [[http://bioinfo-shiny.ird.fr:3838/COVIDSIM/|effets de mesures de contrôle de santé publique]] limitant la propagation du virus SARS-CoV-2 sur le déroulement de l’épidémie de COVID-19

====== Du côté Do-it-yourself ======
===== Solution hydro-alcoolique =====
  * la [[https://fr.wikipedia.org/wiki/Solution_hydro-alcoolique|solution hydro-alccolique]] 
  * [[http://www.who.int/gpsc/5may/tools/system_change/guide_production_locale_produit_hydro_alcoolique.pdf|protocole de fabrication de la solution par l'OMS]]
  * essais in vitro de différentes concentrations d'alcool : on observe un effet virucide à partir de 40% d'éthanol. "[[https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.10.986711v1|Efficient inactivation of SARS-CoV-2 by WHO-recommended hand rub formulations and alcohols]]"

===== Masques =====

voir la page du Laboratoire Autonome de Biologie : Alternatif, Solidaire et Expérimental [[https://lebib.org/wiki/doku.php?id=labase:medecine_autonome|LABASE)]]

  * [[https://www.cambridge.org/core/journals/disaster-medicine-and-public-health-preparedness/article/testing-the-efficacy-of-homemade-masks-would-they-protect-in-an-influenza-pandemic/0921A05A69A9419C862FA2F35F819D55|Testing the Efficacy of Homemade Masks: Would They Protect in an Influenza Pandemic?]] in Disaster Medicine and Public Health Preparedness 7(4):413-418 · August 2013 -- article disponible sur [[http://sci-hub.tw/|Sci-Hub]]

===== Forums & infos DIY =====

  * [[https://coronavirustechhandbook.com/hardware|Tech Handbook]]
  * [[http://foro.coronavirusmakers.org/index.php?p=/|Creación de respiradores / ventiladores abiertos]]
  * BBC news : "[[https://www.bbc.com/news/technology-51911070|Coronavirus: 3D printers save hospital with valves]]"

  * [[https://docs.google.com/spreadsheets/d/1ZQ-Ps4VKypxTGis_BXzFwxxcaQotbb4GUSLEmsxWcXY/edit#gid=0|sites d'entraides répertoriés par les scientifiques]]
Remy Froissart, CNRS

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